Druhá trojice akvárií, která se nachází u vstupu do subtropického skleníku se věnuje fauně a flóře Neotropis (tropů nového světa, tj. Střední a Jižní Ameriky). Akvária byla postavena spolu se skleníky mezi lety 2005–2007 a jejich rekonstrukce se chystá na rok 2026. U těchto akvárií neprobíhala v minulosti taková obměna rybí osádky, neboť byla vždy věnovaná Střední a Jižní Americe, a jejich součástí byly vždy ryby.
Přehled jednotlivých akvárií
| Biotop | Objem | Počet pěstovaných taxonů | Počet chovaných taxonů |
| Střední Amerika |
2 500 l |
1 | 6 |
| Jižní Amerika | 2 500 l | 0 | 3 |
| Jižní Amerika | 2 500 l | 5 | 11 |
První akvárium je věnované středoamerickým cichlidám, které mají zajímavé sociální a reprodukční chování, zejména stojí za pozornost jejich rozvinutá rodičovská péče. Na rozdíl od většiny ostatních ryb, které po nakladení jiker často zanechají potomstvo napospas osudu, cichlidy je aktivně chrání a starají se o ně až do relativně pokročilého stadia. Tato péče může zahrnovat čištění jiker, obranu teritoria před vetřelci nebo přemisťování potěru do bezpečných zákoutí akvária.
V prostředním akváriu jsou chovány dva jedinci piraně plodožravé (Piaractus brachypomus, syn. Colossoma brachypomum). Piraňa plodožravá patří mezi všežravce – konzumuje zelené krmivo, rybí maso, červy, plody i speciální umělá krmiva. Má velké, silné, ploché zuby, s jejichž pomocí drtí skořápky ořechů či pecky. Pohlaví je velmi těžce zjistitelné. Mladší jedinci mají stříbřitou barvu s červeným břichem, v dospělosti se však jejich zbarvení mění na černé.
Akvárium doplňují vrubozubci paví (Astronotus ocellatus). Jejich domovinou jsou stojaté nebo pomalu tekoucí vody jihoamerických řek. Jsou to dravé a velmi čilé ryby, které lze chovat jen s podobně velkými rybami schopnými se bránit. Vrubozubci jsou naprosto neúnavnými dělníky při přestavbě akvária. V nádrži neustále něco přehrabují, přemisťují a poškozují rostliny – ani velké kameny jim nedělají velké problémy. Při stresu se položí na dno a dlouhou dobu předstírají, že jsou mrtvé.
Kančík příčnopruhý (Amatitlania nigrofasciata) pochází z vod Střední Ameriky (Guatemala, Nikaragua, Panama). Stejně jako vrubozubec paví patří mezi budovatele, kteří neustále převrací dno vzhůru nohama. Samec je podstatně větší a mohutnější, zatímco samice je pestřeji vybarvena, na bocích má zlato-oranžové šupinky a tyrkysový nádech hřbetní a řitní ploutve.
Poslední akvárium je věnované klasickým zástupcům povodí Amazonky, jako jsou tetry nebo skaláry. Mezi nejoblíbenější akvarijní ryby patří skalára amazonská (Pterophyllum scalare), která byla do Evropy přivezena v roce 1911 a záhy se stala velmi oblíbenou. Její domovinou jsou pomalu tekoucí a zarostlé vody v Amazonii. Dosud bylo vyšlechtěno cca 41 barevných forem a zároveň je známo 30 různých barevných populací v přírodě.
O jihoamerické akvárium se kromě našich chovatelů stará i jedna ryba – krunýřovec (Ancistrus sp.). Tuto rybu můžete často spatřit přilepenou na předním skle akvária, jak se živí řasami pomocí škrabkovitých úst. Tělo kryjí četné kostěné destičky, které připomínají krunýř. Jejich aktivita je převážně za soumraku a v noci. Označení sp. (species) nese kvůli mnohačetným křížením tří přírodních druhů – krunýřovce mnohoostného (A. multispinis), krunýřovce skvrnitého (A. cirrhosus) a krunýřovce modrého (A. dolichopterus).
Echinodorus – šípatkovec
Vodní a vlhkomilné rostliny pocházející z Ameriky (jejich rozšíření je od Spojených států až po Argentinu). Pro zlepšení vzhledových a pěstebních vlastností byl šípatkovec křížen a vy si můžete v obchodech s akvaristikou tyto kříženec pořídit.
Vallisneria – zákruticha
Rostlina je se svými 26 druhy rozšířena téměř po celém světě, v západní a střední Evropě bývá nacházena zplanělá ve volné přírodě. Množí se nejenom vegetativně pomocí dceřiných rostlin, ale i pohlavně. Plodem je tobolka.
1. Věděli jste, že existují zásobní akvária?
Nachází se ve stejné místnosti jako neotropická akvária, jen jsou veřejnosti nepřístupná. Jsou čtyři menší a slouží nejenom jako karanténa, ale i jako odchovna mladších ryb nebo zásoba mladých rostlin pro akvária.
2. Akvária ideálně navazují na botanické expozice
U paleotropických akvárií to tak pěkně nesedí, ale neotropická akvária navazují na linii od orchidejové vitríny, kde jsou ve skleníku představeny tropické deštné lesy Jižní Ameriky (s důrazem na Brazílii) a Střední Ameriky (s důrazem na Mexiko a Guatemalu). Jedna celá strana skleníku je tudíž neotropická.
3. Proč nemá prostřední akvárium rostliny?
V tomto akváriu pracují samý inženýři, kteří neustále přeskupují kameny a z jakéhokoliv rostlinného akvária by vytvořili kůlničku na dříví.
4. Piraně fascinují
Jsou to divoši, ovšem kromě rybího masa a granulí si rádi pochutnávají na nakrájených jablkách.
5. Věděli jste, že jsme chovali arowanu dvojvousou?
Po otevření skleníků byla trojice akvárií osázena následovně: akvárium s tetrami, „černá Amazonie“ obydlená skalárami, a poslední akvárium s rejnoky a jedním jedincem arowany dvojvousé (Osteoglossum bicirrhosum). Vzhledem k prostorovým podmínkám se však arowana odstěhovala do Botanické zahrady hl. m. Prahy.